Discovery of novel biomass degrading enzymes based on PROtein structure SIGNatures through a Deep Learning Method (PROSIGN)

De omzetting van plantenbiomassa als duurzaam alternatief voor fossiele grondstoffen is sterk afhankelijk van efficiënte enzymen. Identificatie van nieuwe betere enzymen gebeurt meestal op basis van sequentie-overeenkomst van de enzymen. Er zijn echter enkele voorbeelden van enzymen met een lage sequentie-overeenkomst, maar met een vergelijkbare structuur en functie, wat suggereert dat op sequentie-overeenkomst gebaseerde methoden potentieel waardevolle kandidaten negeren. Ik zal een Deep Learning model ontwikkelen dat de identificatie van nieuwe kandidaat-enzymen mogelijk maakt op basis van vergelijkbare eiwitstructuur in plaats van sequentie-overeenkomst, en dit gebruiken om het niet-gekarakteriseerde deel van microbiële genomen te ontginnen voor nieuwe plantenbiomassa afbrekende enzymen.